Первая православная церковь в Екатериненштадте, ныне известном как город Маркс, была возведена в 1838 году на кладбище в начале Екатерининской улицы и выглядела как обычный деревянный дом. В 1848 году к ней добавили колокольню и дома для священника и причетника. В 1867 году приход насчитывал 142 прихожан, а через два года их количество превысило 350 человек.

Екатериненштадт был единственной из поволжских колоний немецких переселенцев, где построили православный храм, что подчеркивало его важность среди других колоний. Прихожанами были в основном купцы и ремесленники.

Со временем деревянная церковь обветшала, и было решено построить новую каменную. Место для строительства выбрали на том же кладбище. Средства на строительство жертвовали русские купцы, а также немцы, католики и лютеране. С каждого мешка пшеницы, отправляемого с местной пристани, отчисляли по одной копейке серебром в течение нескольких лет. 22 сентября 1874 года епископ Самарский и Ставропольский Герасим освятил новый храм, расположенный на месте нынешней Интернациональной площади в районе парка. Храм имел два престола: в честь Воздвижения Честного и Животворящего Креста Господня и святой великомученицы Екатерины.

В мае 1930 года храм был разрушен, а на его месте разбили Парк культуры и отдыха. Ветхая деревянная церковь на кладбище также не уцелела. Настоятель, иеромонах Василий Марин, был увезен в неизвестном направлении, и службы стали проводить в домах верующих. На последней службе в Крестовоздвиженском храме отец Василий попросил прихожан забрать святые иконы. Рискуя, верующие смогли спасти некоторые из них. Две иконы, Спасителя и Архистратига Михаила, хранятся в современном храме.

Свято-Андреевский приход был создан в 1989 году. Согласно решению Марксовского городского Совета народных депутатов от 15 августа 1990 года, православной общине безвозмездно передали здание под храм. 13 декабря 1990 года по благословению архиепископа Саратовского и Вольского Пимена Хмелевского состоялось собрание общины, где решили проводить богослужения в жилом доме семьи Санаевых на улице Рабочая.

В 1996 году началось строительство нового каменного храма. В этом помогали городская администрация, предприятия, предприниматели и жители города и района.

25 ноября 2001 года священник Василий Деев вместе со священником Вячеславом Голощаповым освятил новый храм во имя святого апостола Андрея Первозванного. 16 мая 2010 года епископ Саратовский и Вольский Лонгин совершил Чин Великого освящения храма.

В последние годы храм был благоустроен: установлены шатер колокольни и купола, приобретены колокола, проведены масштабные внутренние и внешние отделочные работы, обустроена прилегающая территория.