Место обретения иконы Казанской Божией Матери заслуживает особого внимания. В 1579 году чудесное обретение иконы Божией Матери прославило Россию, и сегодня христиане всего мира чествуют Казань как место явления Девы Марии. Это святое место признано и посещаемо всеми христианами: православными, старообрядцами и католиками. Царь Иван Грозный повелел построить церковь на месте обретения чудотворной иконы и создать девический монастырь с кельями и оградой. Указ был выполнен: построили деревянную церковь во имя святой Богородицы Одигитрии и монастырскую ограду. В 1595 году возвели каменную церковь, прослужившую до 1798 года. В этом году, 30 мая, заложили новый собор, освященный в 1808 году. Идея построить часовню на месте явления иконы возникла при посещении Казани великой княгиней Елисаветой Феодоровной 13 июля 1910 года. Перед отъездом она пожелала побывать на месте явления иконы, находившемся под алтарем главного храма. Великая княгиня спустилась в нижний этаж собора, долго молилась и выразила сожаление о запущенном состоянии места. Игуменья Варвара предложила устроить часовню в память трехсотлетия царствования дома Романовых, и княгиня согласилась принять участие в этом святом деле.

В советское время Казанско-Богородицкий монастырь пострадал. Соборный храм использовался как склад для хлеба, зерно ссыпали под иконостас, а в 1932 году он был разрушен вместе с местом обретения иконы. Из кирпича разрушенного храма построили павильоны для кинофабрики «Востоккино», позже в них разместились эвакуированные табачные фабрики. Место бывшего храма частично заасфальтировали, устроили хозяйственный двор и построили проходную табачной фабрики. После передачи территории возрожденному монастырю, археологическая экспедиция под руководством профессора Казанского университета З. М. Слепака летом 2000 года провела раскопки. Целью было найти следы летнего храма и пещерного храма. Были обнаружены следы сооружения, часть его апсиды, где находился вход в «пещерную» часовню собора. В 2008 году здесь была возведена часовня в память о месте обретения иконы Казанской Божией Матери по благословению архиепископа Казанского и Татарстанского Анастасия.