Село Богородичное живописно расположено в долине между меловыми горами, недалеко от Святогорского монастыря, вверх по течению Донца, среди возвышающихся вдоль берега реки Святых Гор. Местность вокруг Богородичного богата археологическими памятниками. Исследователи обнаружили здесь следы древних поселений различных эпох и культур. На территории Святых Гор археологи нашли пять городищ Хазарского каганата: Царино, Сидорово, Святогорское, Теплинское и в селе Татьяновка. Два из них, Теплинское и Святогорское, находятся в непосредственной близости от Богородичного.

В XVI-XVII веках через село проходила посольская дорога из Цареборисова с переправой через Северский Донец в сторону горы Млынковой. Согласно народному преданию, в начале XVIII века икона Божией Матери «Всех скорбящих Радость» была чудесно найдена на поверхности воды одного из сельских колодцев, и с тех пор поселение стало называться Богородичное.

В 1847 году на средства тайного советника Александра Михайловича Потемкина в Богородичном была построена каменная церковь в честь иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость». В «Справочной книге для Харьковской епархии», изданной И. Самойловичем в 1904 году, содержатся сведения о церкви: земельный участок около 3 десятин, пахотные и сенокосные земли, 33 десятины. Неприкосновенный капитал составлял 300 рублей, процентами пользовался причт. Прихожан мужского пола было 1528, женского, 1312. Причту полагались священник, диакон и псаломщик. Жалование священника составляло 141 рубль 12 копеек, псаломщика, 35 рублей 28 копеек, диакон жалования не получал. Причт размещался в церковных домах. В селе действовали земская, воскресная и две церковно-приходские школы.

В 1908 году в храме было уже 2208 прихожан мужского пола и 2052 женского. После закрытия храм некоторое время использовался для хранения зерна, а в 1938-1939 годах его почти полностью разобрали. В церковном доме устроили местный клуб, но строительство нового клуба из церковного кирпича не завершили из-за войны, которая разрушила все недостроенное. Также было почти полностью уничтожено старое сельское кладбище возле храма. Сохранился лишь источник, где чудесным образом была найдена икона Божией Матери «Всех скорбящих Радость». Этот источник с чистой водой продолжал пользоваться особым почитанием, несмотря на прошедшие десятилетия безбожной идеологии. Хотя многие уже не помнили предание о чуде, воду предпочитали брать именно из него и называли святой. Местные жители рассказывают, что во время войны к источнику часто приезжали за водой для раненых солдат. Этой водой обмывали раны, и они быстро заживали. По словам одних старожилов, источник уничтожили при разминировании территории, по словам других, при строительстве дороги.

История Свято-Скорбященского храма тесно связана с историей Святогорского монастыря. Храм в Богородичном был разрушен после закрытия монастыря и начал возрождаться, когда обитель пережила третье рождение. 5 июня 1997 года святогорцы провели в Богородичном первое богослужение, а 20 июля 2000 года была совершена закладка храма. Участие в строительстве приняли Святогорская обитель, местные благотворители и простые селяне. Большую часть забот по созданию храма взяли на себя братья Луневы. Для отделки и благоукрашения церкви, включая иконостасы, фрески и мозаики, Сергей Георгиевич Лунев приглашал лучших мастеров. За пять лет был построен уникальный храм с пятью куполами, украшенный великолепным иконостасом из зеленого индийского мрамора с позолоченной резьбой. Основные иконы и фрески храма написаны московским мастером А.И. Чашкиным. Храм украшен мозаичными композициями А.Д. Корноухова и Т. Бабушкиной.

Во время строительства святогорская братия приезжала для совершения богослужений. Служили сначала в палатке, потом среди голых кирпичных стен, а позже устроили храм в честь преподобного Сергия Радонежского. Так село получило еще одного святого покровителя. 16 июля 2002 года церковь обрела голос: десять колоколов были освящены и подняты на колокольню. Самый большой колокол весом 1,3 тонны имеет изображение иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» и памятную надпись о том, что отлит он усердием братьев Луневых.

14 февраля 2005 года епископ Алипий и архимандрит Арсений освятили храм в честь иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость». Верхний храм освящал епископ Алипий, нижний, архимандрит Арсений. В новоосвященный храм были вложены мощи святых. Почти сразу после освящения храм был преобразован в Богородичный женский скит Святогорской Лавры. Для насельниц скита рядом с храмом был построен трехэтажный корпус с келиями и трапезной. Первой насельницей стала монахиня Лаврентия, которая позже приняла пострижение в схиму с именем Любовь. В мае 2006 года состоялся первый монашеский постриг, а в декабре того же года скиту присвоен официальный статус. Духовником скита стал архимандрит Зосима Левин.

Недалеко от места прежнего источника устроен новый источник и часовня в честь святого князя Александра Невского. Часовня освящена в 2005 году, а ее роспись выполнена в 2007 году. Внутри находится мраморная чаша с крестом, из которого струится вода.

6 ноября 2008 года в обители праздновали престольный праздник и возвращение старинной иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость», которая пережила революцию и войну и спустя почти 100 лет вернулась в храм. На иконе изображены село Богородичное, прежний храм, источник и школа, а также пророчество Божией Матери о месте нового храма.

С каждым годом в храм приходило все больше людей, особенно на воскресные и праздничные богослужения. В престольные дни храм не вмещал всех богомольцев, и началось строительство более вместительного двухэтажного храма: верхний посвящен Благовещению Пресвятой Богородицы, нижний, князю Владимиру. Начало строительства было положено 29 октября 2009 года.

10 июля 2010 года архимандрит Зосима Левин освятил установленный при въезде в село Поклонный Крест. 14 июня 2013 года архиепископ Арсений освятил колокола для новостроящегося храма, а 15 августа, кресты, которые были установлены на храме в честь Благовещения Пресвятой Богородицы.