История Благовещенской церкви тесно связана с древним родом Апраксиных. Первые представители этого рода, прибывшие в Москву на службу к великому князю Иоанну III, были внуками Солохмира, выходца из Золотой Орды, который принял имя Иоанн после крещения. С тех пор Апраксины стали неразрывно связаны с Иоанно-Златоустовским монастырем: они заботились о нем, украшали и благоустраивали его, а также построили три церкви: во имя великомученика Феодора Стратилата, мученика Василиска и Благовещения Пресвятой Богородицы.

Благовещенская церковь была построена в 1712 году генерал-адмиралом графом Федором Матвеевичем Апраксиным над могилами его родственников. Материалы для строительства, кирпич, бут и известь, были предоставлены его сестрой, царицей Марфой Матвеевной, вдовой царя Фёдора Алексеевича. Церковь стала родовой усыпальницей Апраксиных. Здесь были похоронены прадед Фёдора Апраксина, Пётр Никитич, дед Василий Петрович, отец Матвей Васильевич, погибший в 1668 году, и другие члены семьи. В 1728 году здесь были похоронены сам Фёдор Матвеевич, его брат Пётр, а в 1732 году, брат Андрей. Все они были сподвижниками Петра I и посвятили свои жизни реализации его грандиозных планов.

Среди соратников Петра I особенно выделялся генерал-адмирал граф Ф.М. Апраксин, один из основателей русского военного флота и строитель первых кораблей. В 1708 году он защитил Санкт-Петербург от шведов, в 1710 году способствовал взятию Выборга, а в 1714 году вместе с царём одержал победу в сражении при Гангуте. Эта победа стала первой для молодого русского флота и теперь отмечается 9 августа как День воинской славы России. Ф.М. Апраксин, кавалер орденов Андрея Первозванного и Александра Невского, выиграл ключевые сражения в Северной войне и Персидском походе, стал первым президентом Адмиралтейств-коллегии и членом Верховного Тайного Совета.

Какие бы должности ни занимал Ф.М. Апраксин, он оставался главным благотворителем Златоустовского монастыря. Невозможно перечислить всё, что он сделал для обители, но можно уверенно сказать: каждый камень в монастыре помнит его.

После разрушения Благовещенской церкви в 1933 году от усыпальницы Апраксиных не осталось и следа, и сегодня на её месте расположена автостоянка. Наш общий долг, восстановить историческую справедливость и увековечить память выдающихся сынов Отечества.