Les vieux-croyants de l'accord de Belokrinitsa à Kazan, appartenant à l'Église orthodoxe ancienne, ont pu construire leur église dans la ville seulement après la publication, le 17 avril 1905, du manifeste de l'empereur Nicolas II, qui renforçait les principes de tolérance religieuse.

En novembre 1906, une liste de souscription a été ouverte pour collecter des dons pour la construction de l'église. Les fonds provenaient de dizaines de marchands de Kazan et de Moscou. La pose de la première pierre a eu lieu en juillet 1907 sous la direction de deux prêtres vieux-croyants de Kazan, Pierre Danilovitch Zaletov et Alexeï Ivanovitch Kalaguine.

Le 6 septembre 1909, selon le vieux style, l'église a été consacrée en l'honneur de l'apparition de l'icône de la Vierge à Kazan.

Sous l'autel de l'église ont été enterrés l'évêque de Kazan et de Viatka Ioasaph et le père P. D. Zaletov. Leur lieu de sépulture n'a été découvert qu'en 2016.

A. I. Kalaguine a servi dans l'église de l'Intercession depuis sa fondation jusqu'à sa fermeture pendant l'époque soviétique.

En mai 1922, la Commission de saisie des valeurs ecclésiastiques a confisqué plus de deux poods d'argent de la cathédrale de l'Intercession sous forme de cadres d'icônes, de censers, de vases et de pièces de monnaie. Quelques années plus tard, l'église a été fermée.

Plus tard, le bâtiment de l'église a été transféré à l'Archives d'État centrale de la République du Tatarstan, où étaient conservés des documents du département des fonds d'avant-révolution. Pendant la Grande Guerre patriotique, une partie des archives évacuées à Kazan y a également été placée. Selon les souvenirs de Vassili Kirillov, le bâtiment était complètement rempli d'étagères avec des documents, et l'église elle-même était fermée et entourée d'une clôture en béton.

Par la décision du Cabinet des ministres de la République du Tatarstan n° 642 du 1er août 1996, le bâtiment de l'église vieux-croyante de l'Intercession a été transféré à la société religieuse enregistrée des vieux-croyants de l'accord de Belokrinitsa pour satisfaire les besoins religieux des croyants.

En 1997, l'évêché de Kazan-Viatka de la RPSC a été restauré, et l'église de l'Intercession est devenue cathédrale. Sa restauration progressive a commencé.

L'évêque de Kazan et de Viatka Andrian a décidé de créer un musée dans l'église. Le protodiacre Gennadi Tchertvergov se souvenait qu'ils discutaient de l'importance de partager des icônes et des livres rares avec les gens, afin qu'ils puissent ressentir la grâce émanant de ces saintes reliques.

En raison de l'inachèvement de la restauration, il n'a pas été possible de tenir le Concile Sacré dans l'église à la fin de 2009.

Le 6 décembre 2016, un monument au métropolite Andrian a été inauguré devant la cathédrale de l'Intercession, créé par le collectif du groupe de sociétés « Irèk ».