La création de l'État grec a impliqué trois puissances : l'Empire russe, la France et l'Angleterre. Avant le début de la révolte grecque contre la domination turque, Ioannis Kapodistrias vivait en Russie et occupait le poste de ministre des Affaires étrangères de l'Empire russe sous l'Empereur Alexandre Ier de 1816 à 1822. Devenu le premier dirigeant de la Grèce indépendante, le comte Kapodistrias soutenait le "parti russe", ce qui déplaisait aux "partenaires" de la Russie, la France et l'Angleterre.

Le 27 septembre (9 octobre) 1831, le comte Kapodistrias a été brutalement assassiné à Nauplie, à l'entrée de l'église Saint-Spiridon, par les frères Konstantinos et Georgios Mavromichalis, représentants du clan Mavromichalis, partisans de la France dans l'Alliance des puissances. Le comte a été enterré sur l'île de Corfou, où il est né, dans le monastère de la Mère de Dieu "Platytera", où se trouve le caveau familial des Kapodistrias. Il a été enterré dans les mêmes vêtements qu'il portait au moment de son assassinat, n'ayant tout simplement pas d'autres vêtements, et l'argent qu'il avait apporté à Nauplie, il l'a distribué aux nécessiteux.

Des monuments à la mémoire de Kapodistrias ont été érigés à Corfou, à Nauplie, à Athènes, à Genève et à Saint-Pétersbourg.