La création du musée de la nature est étroitement liée à l'histoire de la réserve de Pechora-Ilych. À l'origine, il a été conçu comme un musée de la réserve, et ses collections se sont formées à partir des collectes sur le terrain réalisées par le personnel. La particularité du musée réside dans le fait que ses expositions sont des objets biologiques qui servent de sources d'informations scientifiques. Les expositions présentent presque toutes les espèces de vertébrés vivant dans cette région, ainsi que des moments historiques importants des peuples de la région.

Le musée a été officiellement ouvert le 1er juin 1973. Depuis 1996, il est géré par le département de l'éducation écologique et constitue le principal lieu de travail avec les visiteurs.

Les fonds du musée conservent des collections botaniques et zoologiques, rassemblées par le personnel dans des endroits difficiles d'accès de la réserve, qui ont une grande importance pour la recherche scientifique. Une fierté particulière du musée est sa vaste collection de crânes d'animaux, comptant 1525 spécimens. Le musée abrite également une collection privée de crânes de petits mammifères, d'environ 20000 pièces, ainsi que des crânes d'élans.

La collection paléontologique est petite et principalement organisée selon des principes géochronologiques et systématiques. Elle est dominée par des invertébrés : coraux, bryozoaires, mollusques. Les restes osseux de vertébrés sont beaucoup moins nombreux. Les fossiles ont non seulement une valeur scientifique, mais aussi éducative, et sont largement utilisés lors des visites thématiques. Des collections de spécimens taxidermisés d'animaux sont utilisées pour les expositions.

Un intérêt particulier est suscité par les expositions d'animaux à coloration inhabituelle. Ce sont des peaux d'écureuils avec des taches blanches sur fond fumé, des écureuils sombre-fumés, beige, avec une bande jaune sur le dos et presque noirs, ainsi qu'un écureuil volant taxidermisé de couleur claire.

Dans la salle d'histoire locale, une exposition historique et ethnographique est présentée.