L'église de Saint Onuphre à Anapa, construite au 19ème siècle, est un monument historique. Sur son territoire se trouvent une salle à manger et une prosforna. Après la prise de la forteresse d'Anapa en 1828, l'église a été détruite. L'isolement du monde extérieur, la menace constante d'attaques et le manque d'eau potable pesaient sur les habitants. Le 3 octobre 1830, Nicolas Ier ordonna la construction d'une église gréco-russe dans la forteresse d'Anapa avec un iconostase, allouant 25 000 roubles à cet effet. L'église a été nommée en l'honneur du saint, le jour de la prise de la forteresse.

L'histoire de l'église a commencé après la capitulation du garnison turc le 12 juin 1828, le jour de la mémoire de Saint Onuphre le Grand. Les soldats y ont vu une protection céleste, et sur les ruines de la forteresse, une église a été érigée en l'honneur de Saint Onuphre, qui est devenu le patron d'Anapa. L'empereur Nicolas Ier a visité l'église en septembre 1837.

Le 2 janvier 1878, Anapa a été bombardée par un navire turc, et l'une des obus a percé l'église. Cet endroit a été marqué d'une peinture noire. Parmi les paroissiens de l'église se trouvaient des personnalités connues, telles que le général D.V. Pilenko et la poétesse E.Yu. Kuzmina-Karavaeva. Pendant les révolutions et la guerre civile, l'église est restée un centre spirituel pour les citadins.

Dans les années 30 du XXe siècle, l'église a été saccagée par les bolcheviks, les cloches ont été enlevées, les dômes détruits, et le bâtiment a été transformé en musée. Pendant la Seconde Guerre mondiale, les occupants ont permis de célébrer des services religieux. En 1943, le vieil Onuphre a aidé les troupes soviétiques en indiquant les positions de tir de l'ennemi.

Depuis 1959, les services dans l'église étaient dirigés par le prêtre Nikolai Melnikov, un prêtre-poète connu. En 1964, l'église a de nouveau été persécutée, son bâtiment a été transformé en Maison des Pionniers, et les dômes et le clocher ont été détruits.

En 1991, la renaissance de l'église a commencé, elle a été restituée à la communauté orthodoxe. La restauration s'est achevée le 1er décembre, lorsque l'église a été consacrée par l'archevêque Isidore. Le prêtre Victor Polyankin est devenu le recteur, et le prêtre Gennady Klyuchnikov, le prêtre permanent.

Pendant la guerre de Crimée, l'église a été détruite, mais restaurée en 1874 à l'initiative du général D.V. Pilenko. Sur la plaque commémorative, il est indiqué que l'église a été fondée en 1829 et consacrée en 1837. Jusqu'en 1964, l'église était fermée, mais depuis 1995, les services religieux ont repris.

Aujourd'hui, l'église de Saint Onuphre est le centre de la vie spirituelle d'Anapa. Des écoles du dimanche et une bibliothèque orthodoxe y fonctionnent, ce qui témoigne de la renaissance de la foi orthodoxe.