L'histoire de l'église est étroitement liée au développement du village de Petropavlovskoïe, situé près de Shouïa. Le village a été fondé suite à un événement tragique de 1831, lorsque l'épidémie de choléra a emporté de nombreuses vies parmi les habitants locaux. Les cimetières de la ville ne pouvaient pas faire face au nombre de morts, il a donc été décidé de créer une sépulture séparée dans la périphérie peu peuplée de la ville, dans la localité de Rykovo. En mémoire des victimes du choléra, les habitants de Shouïa ont institué une procession avec un jeûne d'une semaine, à partir du 28 juillet. La procession traversait le centre de la ville jusqu'au lieu de sépulture, où une panikhida était célébrée avec la sortie des icônes vénérées. Le lieu d'inhumation était entouré d'un talus de terre, et en 1847, le maire de la ville I.D. Kisselev a érigé un monument en pierre blanche avec une inscription sur les victimes du choléra en 1831.

Dans la seconde moitié du XIXe siècle, la localité a commencé à être activement peuplée. Cela était dû au fait que le propriétaire des terres, le marchand G.V. Bolotov, les louait, attirant ainsi les habitants des villages environnants à la recherche d'opportunités de travail près de la fabrique de Shouïa. Le village grandissait, et il est devenu nécessaire de construire une église. En 1868, sur le site de la sépulture du choléra, une chapelle a été construite et consacrée, qui est devenue plus tard une église. La construction a été financée par le marchand de Shouïa G.V. Bolotov et la citoyenne d'honneur de Shouïa M.I. Shchekoldina. Après l'édification de l'église, la localité de Rykovo a reçu le nom de village de Petropavlovskoïe. Jusqu'en 1876, l'église était rattachée à la cathédrale de la Résurrection, mais elle est ensuite devenue paroissiale grâce à des fonds trouvés pour maintenir un clergé séparé.

À la fin du XIXe siècle, il est devenu évident que l'ancienne église ne répondait pas aux exigences de capacité et d'architecture, il a donc été décidé de la reconstruire. Grâce aux efforts du vieux de l'église E.A. Goussev, une nouvelle église a été construite sur un nouveau site entre 1891 et 1893. Le projet a été développé par l'architecte de Vladimir N.D. Koritski. L'église est réalisée dans le style russe avec des éléments de l'architecture tonique. À l'intérieur, il y avait un sol en fonte et un poêle à air, et le chœur contenait 20 icônes sur fond doré. La grande cloche pesait 160 pouds. Le temple a été remis à l'église le 30 janvier 1996, et le premier service a eu lieu le 11 avril de la même année. En 2002, le chœur a été restauré, et depuis 2003, le temple abrite les reliques de Saint martyr Avksentiy. Actuellement, le temple est activement restauré : une nouvelle clôture et un dôme ont été installés, des réparations ont été effectuées, et la restauration du clocher est prévue.