La première mention du village date de 1835, lorsque la construction de la fortification de Nikolaïev a commencé. Les cosaques et les soldats ont érigé des bâtiments résidentiels, des entrepôts et des bâtiments pour l'administration du stanitsa. Pour se protéger des raids des nomades, un profond fossé a été creusé autour du village et une haute levée de terre a été construite. Cependant, cela s'est avéré insuffisant, et les cosaques ont commencé à construire un mur fortifié. Celui-ci était haut et solide, avec des tours d'angle. En 1847, une église a été construite, dédiée à saint Nicolas, et ce nom s'est répandu au village.

L'église était en briques, ayant une forme cruciforme à l'extérieur avec des sorties centrales et latérales. La hauteur du bâtiment du sol au corniche était de 15 à 17 mètres, le plâtre était à base de chaux. Au centre de la partie supérieure, après la corniche, la structure se terminait par une voûte en briques, sur laquelle se trouvait un dôme central en construction en bois, recouvert de fer à toiture et surmonté d'une croix d'environ 6 à 7 mètres de haut. En plus du grand dôme, trois petits dômes et un dôme pour les cloches se trouvaient sur les côtés. Sur les murs de la voûte, il y avait des peintures et des inscriptions. En face de l'entrée centrale se trouvaient des chœurs et un chœur décoré en bois. Le sol était en bois.

Les cosaques prenaient soin de leur église avec amour, et, selon les anciens, par sa beauté et ses offices, elle n'était pas inférieure à celles des villes. L'éloignement du village des grands centres urbains a aidé à préserver le bâtiment de l'église en temps difficiles, et les services y ont continué encore plusieurs décennies sous le pouvoir soviétique.

Dans les années 1950-1960, l'église de Nikolaïev était dans un état terrible, car elle était utilisée comme entrepôt pour les grains. Cependant, les icônes et les dômes recouverts de feuille d'or ont été préservés jusqu'en 1985. En 1985, des "restaurateurs" arrivés ont enlevé le revêtement des dômes et ont commencé la restauration, mais ne l'ont jamais achevée. La situation s'est aggravée avec deux incendies à l'intérieur du bâtiment. La façade extérieure conservait encore une apparence de prospérité, bien que les dômes soient écaillés et recouverts de métal galvanisé, tandis qu'à l'intérieur, tout avait l'air désastreux.

Ce remarquable monument architectural du XIXe siècle a été restauré en 1990. Par ordre du Ministère de la culture de la Fédération de Russie et de l'Agence fédérale des biens de l'État du 16 juillet 1996, le bâtiment de la forteresse de Nikolaïev avec l'église dans le village de Nikolaïevka du district de Varna a été transféré à l'usage gratuit et indéfini de l'Éparchie de Tcheliabinsk de l'Église orthodoxe russe.