L'église en bois, construite entre 1690 et 1696, se trouve à l'ouest du Kremlin. C'est un haut temple de forme colonnaire, composé d'un grand cube, surmonté d'un bas quart et d'un octogone, couronné d'une grande coupole en forme d'oignon sur un col rond. Du côté est, un petit autel pentagonal est attenant au cube, et du côté ouest, une salle à manger allongée. La composition du bâtiment est typique pour de tels temples, à l'exception du deuxième niveau quadrangulaire, qui a généralement la forme d'un octogone. Le puissant cube du premier niveau avec un renflement en haut et les niveaux supérieurs sont couronnés de toits à pentes. Les murs du temple et de la salle à manger sont taillés « en oblo », tandis que l'autel est taillé « en patte ». Les côtés intérieurs des rondins sont dégrossis. Le volume bas de l'autel est terminé par un toit à pannes à cinq pentes, recouvert de bardeaux, dont les extrémités sont décorées en forme de pointe tronquée. De petites fenêtres en arc dans les côtés est, nord et sud de l'abside sont ornées de chambranles. Tous les niveaux du temple sont couverts de bardeaux, dont les extrémités sont également décorées en forme de pointe tronquée. Le col et la coupole en forme d'oignon sont recouverts de lames.

La salle à manger a un toit à deux pentes abaissé avec des « poules », recouvert de bardeaux. Le toit de la salle à manger dépasse considérablement au-dessus du porche ouest. Des pignons sculptés, dont la jonction est terminée par un « torchon », passent le long du bord des toits et couvrent les extrémités extérieures des pannes de toiture. Un toit similaire est aménagé au-dessus du porche ouest. Dans le quart du temple, sur les façades sud et nord, des fenêtres en arc sont disposées en deux lumières. Dans le mur ouest du quart, au niveau de la deuxième lumière, se trouvent trois petites fenêtres.

Ce monument appartient au type à niveaux des églises en bois, qui étaient très répandues à la fin du XVIIe et au début du XVIIIe siècle. Sa solution volumétrique et spatiale et ses proportions parfaitement trouvées donnent au temple un aspect unique. Le silhouette nette, soulignée par un important débord de toiture des différents niveaux, domine la partie ouest de la ville, constituant sa principale verticalité.

À ce jour, un ensemble d'objets authentiques de décoration intérieure a été conservé, représentant une rare curiosité. Ces objets contiennent de la peinture, représentant tout un ensemble d'œuvres artistiques avec une décoration originale des structures de ciel démontable et une peinture inhabituelle de motifs sur la poutre de l'arc d'entrée entre le quart et la salle à manger. Il y a aussi de la peinture sur les rondins de la nef du temple et de la peinture à l'huile de la fin du XVIIIe siècle sur des toiles démontables du ciel du quart, datant de différentes périodes de création.

Le retable conservé compte 124 icônes, qui se trouvent actuellement dans la collection du musée historique et artistique d'État de Kirillo-Belozersk. Les icônes sont réalisées dans la technique de la peinture à tempera et datent de la période de construction de l'église en bois. Une partie des icônes a été restaurée par des artistes restaurateurs de la SRPM de Vologda entre 1987 et 1995.

En 2008, la restauration de l'église d'Élie le Prophète a commencé. En 2009, les objets de décoration du temple ont été démontés, et avant leur transport, leur peinture a été renforcée par des artistes restaurateurs du GosNIIR de Moscou. Actuellement, les objets sont en cours de restauration.

Le 24 décembre 2012, les travaux de conservation et de restauration sur la peinture de l'arc d'entrée du portail, le ciel démontable du voûtement, l'icône « Sauveur Tout-Puissant » et les rondins de la nef de l'église en bois ont été achevés.

En 2012, les travaux de réparation et de restauration pour l'assemblage du temple ont continué, réalisés par la société à responsabilité limitée « Héritage » de Vologda.