El monasterio fue fundado junto a la iglesia de San Pedro y San Pablo, construida por el venerable Pedro, príncipe de los Ordá, por orden y con los recursos recibidos de los apóstoles Pedro y Pablo, quienes se le aparecieron de manera milagrosa. Al final de su vida, el príncipe tomó el hábito aquí y falleció en 1290. Sus reliquias descansan bajo el suelo en la pared sur de la catedral de San Pedro, frente al iconostasio, y a lo largo de los siglos se han glorificado con numerosos milagros. En 1322, durante la invasión del kan Ajmyl, el bisnieto de Pedro, Ignacio, y el santo de Rostov, Projor, se encontraron con el kan en el monasterio de San Pedro. Le contaron la historia de la comunidad y su fundador, y el santo Projor sanó al hijo del kan. Impresionado, Ajmyl recompensó generosamente al obispo y al clero y detuvo las destrucciones. No se conservan datos sobre los siguientes tres siglos de historia del monasterio. Se menciona nuevamente en 1608, cuando fue devastado y quemado por los lituanos y traidores rusos. En 1684 se construyó una nueva catedral de San Pedro, y en 1696, la iglesia de la Alabanza a la Santísima Virgen. En 1764, el monasterio fue dejado fuera de la lista y se mantuvo de manera independiente. En 1805 se erigió el edificio del hermano. En el siglo XIX se construyó el campanario, cuatro torres en las esquinas y las murallas del monasterio. Todos estos edificios de ladrillo, incluidas las iglesias del siglo XVII, se conservaron hasta 1933. En 1933, el monasterio fue confiscado y destruido. En 1933-1934 se desmantelaron la catedral, el campanario y las murallas. Las torres, el edificio del hermano y la iglesia de la Alabanza a la Virgen se utilizaron como vivienda. En la iglesia se instaló una cervecería y otras industrias. El último propietario secular, LLC Rostovagropromenegro, se declaró en quiebra en 2004. Para entonces, los edificios restantes consistían en dos estructuras de tres pisos y dos de dos pisos, así como una iglesia muy remodelada y descuidada. En el lugar de la catedral se construyeron garajes. Todo esto estaba rodeado de casas residenciales, zanjas de drenaje con agua estancada y basura. En abril-mayo de 2005, con fondos de benefactores, se compraron los edificios administrativos y de servicio de la empresa en quiebra y el primer piso del edificio del hermano. El 13 de julio de ese mismo año, en la parte de la refectorio del edificio sobreviviente de la iglesia de la Alabanza a la Virgen, el arzobispo de Yaroslavl, Kirill Nakonechny, celebró la primera Divina Liturgia en mucho tiempo. Después de esto, comenzaron los servicios regulares en el monasterio renaciente. Se abrió una escuela dominical en la comunidad. Tras fenómenos inusuales que indicaron la posible ubicación de las reliquias del venerable Pedro, se desmanteló el garaje en este lugar y se erigió una cruz conmemorativa. El 24 de diciembre de 2010, el Santo Sínodo bendijo la reapertura del monasterio.