Un pequeño palacio neoclásico en el callejón Granatny fue construido entre 1899 y 1900 para Vilhelmina Ivanovna Rekk, esposa del conocido empresario Yakov Andreevich Rekk, fundador de una de las mayores compañías de construcción de Moscú, la Sociedad Anónima de Comercio y Construcción de Moscú.

A finales de siglo, Yakov Rekk introdujo en Moscú un nuevo concepto europeo, la construcción de palacios "llave en mano", completamente listos para habitar y destinados a la posterior venta. Su objetivo era, como él mismo decía, "embellecer Moscú con casas elegantes que, poseyendo las comodidades técnicas de los edificios urbanos de Europa Occidental, mantuvieran el colorido nacional de Moscú". En el marco de las actividades de su sociedad constructora, Rekk erigió numerosos palacios en estilo modernista y neoclásico. El palacio en el callejón Granatny fue probablemente uno de esos proyectos.

El edificio fue construido en estilo neogriego con elementos neoclásicos, y en su diseño participó el conocido arquitecto Vladimir Vladimirovich Sherwood. En 1905, se añadió una extensión al edificio, realizada según el proyecto de otro conocido arquitecto de principios del siglo XX, Vladimir Dmitrievich Adamovich. La fachada asimétrica está decorada con delicados adornos de estuco, marcos de ventanas, cornisa y frisos con temas antiguos, destacando especialmente la gran ventana de la extensión. El pórtico del segundo piso, situado sobre la entrada, está adornado con dos columnas de orden jónico y rematado con un frontón. En los interiores del palacio se ha conservado parcialmente la decoración en estilo neoclásico.

Tras la finalización de la construcción, el palacio fue vendido a Nikolai Alexeevich Protopopov, comerciante de la primera guilda y ciudadano honorario de herencia. Protopopov alcanzó el rango de consejero estatal efectivo, fue elegido del estamento comercial de Moscú, director de la Sociedad Rusa de la Cruz Roja y miembro honorario del Consejo de orfanatos. Se dedicó activamente a la caridad, financiando, entre otras cosas, la construcción y mantenimiento del Instituto Comercial de Moscú y la creación de la Sala Asiria en el Museo de Bellas Artes. Protopopov estaba relacionado con la familia de comerciantes Bakhrushin, su esposa era Klavdiya Alexandrovna Bakhrushina.

En los últimos años antes de la revolución de 1917, el palacio fue propiedad de Semyon Alexandrovich Nazarov, noble de herencia.

Tras la nacionalización, en el edificio se alojaron diversas instituciones soviéticas, como el Consejo Militar Supremo del Comisariado del Pueblo para Asuntos Militares y el albergue de la Internacional Roja de sindicatos.

Actualmente, el palacio alberga la embajada de la República de Tayikistán.