El templo, conocido como "Nicolás el Milagroso de Gosti", se menciona en los libros de registro desde 1565. Estaba ubicado en la plaza comercial junto al Mercado de Gosti y fue consagrado en honor al patrón de los comerciantes, San Nicolás el Confesor. Aunque la fecha exacta de construcción del templo de piedra es desconocida, su arquitectura indica que es del siglo XVI.

Según los libros de registro, la iglesia "Nicolás el Milagroso de Gosti" se encontraba detrás de la fila de pescados, y su construcción fue obra del sacerdote Grigori y de los habitantes laicos. En el patio de la iglesia vivían el sacerdote Grigori, el diácono Petr Isakov, así como ancianos mendigos que recibían alimento de la iglesia. El salario estatal incluía cuatro rublos y pan, así como ingresos de la iglesia por cera, incienso y vino. Al sacristán le correspondía media moneda y grano. En el callejón detrás del Mercado de Gosti había patios a ambos lados.

El sacerdote de esta iglesia fue el futuro patriarca de Moscú y de toda Rusia, Germogen, quien desempeñó un papel importante en la obtención de la milagrosa icono de Kazán de la Madre de Dios en 1579.

En 1594, el metropolitano de Kazán y Astracán, Germogen, escribió sobre las apariciones y milagros de la icono de la Madre de Dios de Kazán, recordando cómo, siendo sacerdote en la iglesia de San Nicolás de Gosti, se emocionó ante la imagen de la Madre de Dios y recibió la bendición del arzobispo para tomar la icono.

A principios del siglo XVII, se añadió una capilla en honor a la icono de la Madre de Dios de Kazán, y en 1634 se construyó cerca una iglesia fría de la Transfiguración.

Hoy en día, el edificio de la antigua iglesia de Nicolás el Milagroso ha perdido ambas cúpulas y ha quedado parcialmente bajo tierra. Hasta 2017, albergó servicios de archivo, incluyendo la oficina de la Administración Principal de Archivos del Gabinete de Ministros de la República de Tatarstán y el Comité Estatal de la República de Tatarstán para Asuntos Archivísticos.

El 30 de agosto de 2017 se registró el "Fondo de Renacimiento de la Iglesia de Nicolás el Milagroso", establecido por la Diócesis de Kazán de la Iglesia Ortodoxa Rusa.