El monasterio masculino de San Trifón Ipatiev está ubicado en la parte occidental de Kostroma, a orillas del río Ipatievka, cerca de su desembocadura en el Volga.

Según una leyenda tardía, el monasterio fue fundado alrededor del año 1330 por el tártaro murza Chet, quien se convirtió en el ancestro de los Gódunov y los Sabúrov. Huyó de la Horda de Oro hacia Iván Kalita y se bautizó en Moscú con el nombre de Zacarías. En este lugar, la Madre de Dios se le apareció junto al apóstol Felipe y el santo mártir Ipacio de Gangra, lo que lo llevó a sanar de su enfermedad.

En las celdas del monasterio, construidas en 1583, desde el otoño de 1612 residieron el joven Mijaíl Romanov y su madre, la monja Marfa. El 13 de marzo de 1613, llegó al monasterio una embajada de la Asamblea de la Tierra, que eligió al joven Mijaíl como zar. La embajada estaba encabezada por el arzobispo de Riazán, Teodorito, el sacristán del monasterio de la Trinidad-Sergio, Abraham Palitsin, y el boyardo Fiódor Sheremetev. El 14 de marzo, en la catedral de la Trinidad del monasterio, se llevó a cabo el solemne rito de la proclamación de Mijaíl Romanov como zar, lo que puso fin al Tiempo de Troubles.