Das Dorf Michałowskaja, gelegen am Fluss Sueri, wurde 1848 von Siedlern aus den zentralen Gouvernements Russlands gegründet. Kurz nach dem Bau einer eigenen Kirche und der Bildung einer Gemeinde erhielt das Dorf den Status des Dorfes Michałowskij, wo jährlich am 9. Mai und 6. Dezember die Nikolausfeiern stattfanden.

Seit seiner Gründung gehörte das Dorf Michałowskaja zur Gemeinde der Znamenskaja-Kirche des Dorfes Mostowskij. 1859 wurde die selbstständige Michałowskaja-Gemeinde gegründet, die neben dem Dorf auch die Dörfer Kroschina, Pessjanaja (Malo-Pessjanaja), Chudorybja, Troizkaja (Novo-Troizkaja), Pershina (Novo-Pershina) und Sungurova umfasste. Ab 1894 gehörte das Dorf Malo-Kroschina zur Gemeinde, und zu Beginn des 20. Jahrhunderts das Dorf Kokorina. Diese Zusammensetzung der Gemeinde blieb bis zu Beginn der 1930er Jahre bestehen.

Im Jahr 1858 begann der Bau einer hölzernen Kirche auf einem steinernen Fundament im Dorf Michałowskaja, die dem Heiligen Nikolaus, dem Wundertäter, gewidmet war. Die Mittel für den Bau wurden von den Einheimischen gesammelt, und die Arbeiten wurden 1859 abgeschlossen. 1861 engagierten die Gemeindemitglieder den Maler Stepan Krutov, um einen vergoldeten Ikonostase mit Schnitzereien und Ikonen im griechischen Stil zu schaffen. Die Weihe der Kirche fand am 9. Mai 1865 statt. Bis zum Ende des 19. Jahrhunderts war die Kirche baufällig, und 1904 wurde das Gebäude an die Retschnowskije Landgesellschaft verkauft, während die Ikonen in die neue Kirche übertragen wurden. Aufgrund der Baufälligkeit und der geringen Kapazität der alten Kirche wurde 1897 beschlossen, eine neue steinerne Kirche zum Gedenken an die Krönung von Kaiser Nikolaus II. zu bauen.

Im Jahr 1900 entwarf der Architekt Nikolai Jushkov das Projekt für eine neue dreischiffige Kirche, die für 1000 Personen ausgelegt war. Die Diözesanleitung genehmigte den Bau, der von den Gemeindemitgliedern finanziert wurde. Den Auftrag für den Bau erhielt der Bauer Georgij Makarov aus dem Omutinskaja-Wald von Jalutorowskij Ujesd.

Die Kirche wurde am 13. Juli 1900 von dem Dekan Peter Burrow eingeweiht. Bis Mai 1905 wurden die Außen- und Innenarbeiten abgeschlossen, und auf die siebenkuppelige Kirche mit hohem Glockenturm wurden neun vergoldete Kreuze gesetzt. 1906 wurden drei geschnitzte vergoldete Ikonostasen nach dem Entwurf von I.A. Chlopotow hergestellt, der auch die Wände und Gewölbe der Kirche malte.

Am 6. November 1906 weihte der Dekan Nikolai Burrow in Anwesenheit von acht Priestern den Hauptaltar im Namen des Heiligen Nikolaus, des Wundertäters. In den folgenden Jahren wurden die Seitenaltäre geweiht: der südliche zu Ehren des heiligen Märtyrers Charalampius am 8. Februar 1914 und der nördliche zu Ehren des Heiligen Theodosius von Tschernigow. Nach der Weihe des zentralen Altars wurde über einen Zeitraum von 10 Jahren eine steinerne Umfriedung mit Metallgittern gebaut, und die Kirche wurde weiterhin mit Wandmalereien geschmückt.

Die Nikolauskirche im Dorf Michałowskij wurde offiziell nicht geschlossen, hörte jedoch 1932 auf zu funktionieren, als das Gebäude als Lager für „Zagotzerno“ genutzt wurde.

Zu Beginn der 1960er Jahre war das Gebäude in einem Notzustand, die Wände waren rissig und die Kirchenumfriedung war zerstört. Doch durch die Bemühungen der Einheimischen wurde die Kirche wiederhergestellt. Der Vorraum und der Narthex wurden renoviert, und nun finden hier jeden Donnerstag Gottesdienste statt.