In der Mitte des 17. Jahrhunderts, während der Wiederherstellung von Karatschew nach der polnischen Zerstörung in der Zeit der Wirren, wurde eine neue hölzerne Kirche auf dem Platz hinter dem alten Hang erbaut. Sie war dem Heiligen Nikolaus gewidmet, der in Russland besonders verehrt wird, mit einer Kapelle des Heiligen Johannes des Kriegers. Historische Quellen berichten, dass die Kirche mit gemeinsamen Anstrengungen des Klerus und der Gemeindemitglieder errichtet wurde. Neben der Kirche befand sich der Gemeindefriedhof und kirchliche Grundstücke, sowie die Kirche besaß Ackerland in den oberen Lagen des Flusses Gore-Gryazi. Im Jahr 1806 wurde die Kapelle des heiligen Märtyrers Johannes des Kriegers durch die Kapelle des heiligen Propheten Elias ersetzt. Dies geschah nach dem Ereignis von 1805, als während einer Dürre in der Stadt ein Kreuzweg mit einem Gebet um Regen stattfand, und vor der Kirche sich der Himmel plötzlich mit regnerischen Wolken verdunkelte, aus denen ein reichlicher Regen fiel. Der Sommer war ertragreich, und zu Ehren dessen beschlossen die Bürger, die Kapelle des heiligen Propheten Elias zu bauen, da bis zur Zeit der Wirren in der Stadt eine Kirche des Propheten Elias existierte, die von den Polen zusammen mit der Stadt zerstört wurde. An diesem Ort wurde die Kirche des Heiligen Nikolaus errichtet.

Im Jahr 1860 wurde die hölzerne Nikolauskirche durch eine neue steinerne Kirche mit fünf Kuppeln an der großen Orlow-Straße ersetzt. Der Bau begann 1855 unter der Leitung des Bauern aus dem Dorf Maslowka, Gawriil Wasiljewitsch Boldyrew, und wurde 1860 abgeschlossen, als die Kirche mit der Segnung des Hochwürdigsten Polikarp geweiht wurde. Ursprünglich hatte die Kirche keinen Speisesaal, sondern drei Altäre: im Namen des Heiligen Nikolaus, des heiligen Propheten Elias und zu Ehren des Ikone der Gottesmutter „Lindere meine Sorgen“. In den Jahren 1862-1863 wurden der Speisesaal und der steinerne Glockenturm angebaut, und es wurden zwei Altäre hinzugefügt: im Namen des Heiligen Tichon von Zadonsk und des heiligen Märtyrers Johannes des Kriegers.

Im Jahr 1871 wurde aufgrund von Rissen in den tragenden Wänden, die durch den instabilen Boden verursacht wurden, der obere Teil der Kirche umgebaut, und anstelle von fünf Kuppeln erschien eine Kuppel.

Nach der bolschewistischen Revolution von 1917 begannen die Verfolgungen des Orthodoxen Glaubens, und die Kirchen wurden eine nach der anderen von der sowjetischen Macht geschlossen. Auch die Kirche des Heiligen Nikolaus wurde 1927 auf Beschluss der lokalen Behörden geschlossen, und mehr als 60 Jahre lang ertönte hier kein Wort Gottes. In den sowjetischen Jahren wurde der Glockenturm abgerissen, und in der Kirche befand sich bis zum Großen Vaterländischen Krieg ein Kino. Während des Krieges war hier ein deutsches Lager für sowjetische Kriegsgefangene, und in den Nachkriegsjahren ein Möbelgeschäft und ein Lager für den Zivilschutz.

Im Mai 1994 fand nach langer Verwahrlosung hier zum ersten Mal ein Gottesdienst mit großer Menschenmenge statt. Im Jahr 2006 wurde die Malerei im zentralen Teil der Kirche abgeschlossen. Derzeit werden Arbeiten zur Wiederherstellung der Fassade der Kirche durchgeführt.