Die Kirche des Heiligen Nikolaus ist das älteste Steingebäude in Balakhna und, mit Ausnahme des Nischni-Nowgoroder Kremls, in der gesamten Region Nischni Nowgorod. Sie ist bemerkenswert, da hier die erste Station der Nischni-Nowgoroder Miliz unter der Führung von Minin und Pozharsky war. Der Legende nach wurde in dieser Kirche Kuzma Minin getauft.

Die Kirche wurde 1552 zur Feier der Eroberung von Kasan durch die russischen Truppen auf Befehl von Iwan IV. dem Schrecklichen erbaut. Dieses einzigartige Bauwerk hat in Russland nur neun steinerne Zeltdachkirchen erhalten, von denen sich zwei im Bistum Nischni Nowgorod befinden: die Kirche des Heiligen Nikolaus in Balakhna und die Kathedrale des Erzengels Michael im Nischni-Nowgoroder Kreml.

Die Nikolauskirche wurde 1917 geschlossen, und bis zu diesem Zeitpunkt beherbergte sie das berühmte wundertätige Marienikone. In der Sowjetzeit wurden in dem Gebäude Werkstätten einer Molkerei untergebracht, später Wohnräume. Im Jahr 2008 wurden die Gottesdienste in der restaurierten Kirche wieder aufgenommen.