Der Tempel wurde auf Befehl von Fürst Dawid Rostislawitsch errichtet, der von 1180 bis 1197 in Smolensk regierte. Genaue Daten über die Bauzeit fehlen. Der Tempel war Teil des architektonischen Komplexes des ländlichen Fürstenhofs. Bis zu seiner Schließung in der ersten Hälfte des 20. Jahrhunderts befand sich hier das weißsteinige Grab von Fürst Dawid. Einige Zeit lang gab es in der Kirche ein Kloster.

Während der Belagerung von Smolensk in den Jahren 1609 und 1611 nutzten polnisch-litauische Truppen das Gebäude als Festung. Im Jahr 1611 wurde hier eine katholische Gemeinde gegründet. Nach der Rückkehr Smolensks zum russischen Staat im Jahr 1654 wurde der Tempel erneut ein Ort für orthodoxe Gottesdienste.

Zu Beginn des 18. Jahrhunderts wurden die oberen Teile der Wände und Gewölbe umgebaut, die Fassadenverkleidung verändert und in den Wänden der Anbauten große Fenster eingebaut.

Im Jahr 1733 wurde dem Tempel eine warme Kapelle hinzugefügt. Bis Ende des 19. Jahrhunderts gab es im Inneren vier Altäre: den Hauptaltar zu Ehren des Erzengels Michael sowie im Namen des Alexius, des Gottesmannes, des frommen Fürsten Alexander Newski und der Märtyrer Boris und Gleb.

In der zweiten Hälfte des 18. Jahrhunderts wurde der Vorsteher der Kirche der Kaufmann Wassili Grigorjewitsch Chlebnikow. Mit dem Segen von Bischof Parfenij wurden in den Jahren 1775-1785 ein steinerner Glockenturm, eine steinerne Umfriedung und ein einstöckiges steinernes Haus in der südwestlichen Ecke des Kirchenareals erbaut. In diesem Haus wurden auf Kosten von Chlebnikow arme und obdachlose Jungen unterrichtet.

In den Jahren 1775-1785 wurde der Tempel weiß getüncht, eine Backsteinumfriedung und ein Glockenturm mit einer Zwiebelkuppel erbaut.

Während des Vaterländischen Krieges von 1812 wurde die Swir-Kirche von französischen Soldaten geplündert, aber nach dem Krieg wiederhergestellt.

Im Jahr 1930 wurde der Tempel geschlossen, und das Gebäude wurde als Militärlager genutzt.

Während des Großen Vaterländischen Krieges verlor das Gebäude sein Dach, und der Putz an den Wänden fiel an vielen Stellen ab.

Im Jahr 1963 wurden bei der Dachinstallation einige architektonische Details des 19. Jahrhunderts entfernt. In den Jahren 1976-1982 wurden die Fassaden und einige architektonische Formen des 12. Jahrhunderts sowie einzelne Details des 18. Jahrhunderts restauriert.

Im Jahr 1990 wurde der Tempel der Diözese Smolensk und Wjasma übergeben, und die Restaurierung des Innenraums begann, der das Aussehen des 12. Jahrhunderts erhalten soll.

Die Gottesdienste wurden 1991 wieder aufgenommen, die Restaurierungsarbeiten dauern an. Der geschnitzte Ikonostase aus weißem Stein und der Altar des Tempels wurden am 21. November 1999 geweiht.